MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	GTTT	2	8	447	454	0 %	75 %	25 %	0 %	384206298
2	NC_017233	TA	3	6	456	461	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
3	NC_017233	ATT	2	6	463	468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206298
4	NC_017233	TAG	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206298
5	NC_017233	TAA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
6	NC_017233	A	7	7	525	531	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
7	NC_017233	AAT	2	6	536	541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
8	NC_017233	AGA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
9	NC_017233	TA	3	6	588	593	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
10	NC_017233	AAG	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
11	NC_017233	TAAT	2	8	654	661	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
12	NC_017233	ATA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
13	NC_017233	TGA	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206298
14	NC_017233	A	8	8	732	739	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
15	NC_017233	A	7	7	745	751	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
16	NC_017233	TGA	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206298
17	NC_017233	AG	3	6	783	788	50 %	0 %	50 %	0 %	384206298
18	NC_017233	AATT	2	8	843	850	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
19	NC_017233	GAA	2	6	851	856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
20	NC_017233	TAA	2	6	885	890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
21	NC_017233	ATG	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206298
22	NC_017233	A	6	6	915	920	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
23	NC_017233	A	7	7	929	935	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
24	NC_017233	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206298
25	NC_017233	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
26	NC_017233	ATAA	2	8	974	981	75 %	25 %	0 %	0 %	384206298
27	NC_017233	GGA	2	6	994	999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206298
28	NC_017233	AGAT	2	8	1011	1018	50 %	25 %	25 %	0 %	384206298
29	NC_017233	ATA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
30	NC_017233	CTG	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206298
31	NC_017233	T	6	6	1085	1090	0 %	100 %	0 %	0 %	384206298
32	NC_017233	TAT	2	6	1120	1125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206298
33	NC_017233	AG	3	6	1135	1140	50 %	0 %	50 %	0 %	384206298
34	NC_017233	AAG	2	6	1195	1200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
35	NC_017233	T	8	8	1222	1229	0 %	100 %	0 %	0 %	384206298
36	NC_017233	GAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
37	NC_017233	AGAA	3	12	1253	1264	75 %	0 %	25 %	0 %	384206298
38	NC_017233	TTA	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206298
39	NC_017233	CAA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206298
40	NC_017233	A	6	6	1313	1318	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
41	NC_017233	TAA	2	6	1319	1324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
42	NC_017233	A	7	7	1507	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	384206299
43	NC_017233	ATTAAT	2	12	1521	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	384206299
44	NC_017233	AGA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206299
45	NC_017233	ACT	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206299
46	NC_017233	T	7	7	1660	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	384206299
47	NC_017233	TGG	3	9	1704	1712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206299
48	NC_017233	AGG	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206299
49	NC_017233	AAT	2	6	1761	1766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206299
50	NC_017233	TGG	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206299
51	NC_017233	AAT	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206299
52	NC_017233	CAG	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206299
53	NC_017233	ATT	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206299
54	NC_017233	A	7	7	1911	1917	100 %	0 %	0 %	0 %	384206299
55	NC_017233	A	7	7	1987	1993	100 %	0 %	0 %	0 %	384206299
56	NC_017233	TTA	2	6	1995	2000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206299
57	NC_017233	AAT	2	6	2102	2107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206300
58	NC_017233	TCT	2	6	2140	2145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206300
59	NC_017233	T	6	6	2148	2153	0 %	100 %	0 %	0 %	384206300
60	NC_017233	GATA	2	8	2432	2439	50 %	25 %	25 %	0 %	384206301
61	NC_017233	CTTT	2	8	2500	2507	0 %	75 %	0 %	25 %	384206301
62	NC_017233	TAT	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206301
63	NC_017233	AG	3	6	2555	2560	50 %	0 %	50 %	0 %	384206301
64	NC_017233	ATATA	2	10	3156	3165	60 %	40 %	0 %	0 %	384206302
65	NC_017233	T	7	7	3182	3188	0 %	100 %	0 %	0 %	384206302
66	NC_017233	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
67	NC_017233	ACA	2	6	3295	3300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206302
68	NC_017233	AAG	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206302
69	NC_017233	A	6	6	3335	3340	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
70	NC_017233	TAA	2	6	3345	3350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206302
71	NC_017233	A	6	6	3357	3362	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
72	NC_017233	A	7	7	3426	3432	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
73	NC_017233	GAA	3	9	3436	3444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206302
74	NC_017233	A	6	6	3475	3480	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
75	NC_017233	TGGG	2	8	3487	3494	0 %	25 %	75 %	0 %	384206302
76	NC_017233	ATA	2	6	3521	3526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206302
77	NC_017233	AT	3	6	3552	3557	50 %	50 %	0 %	0 %	384206302
78	NC_017233	TAA	2	6	3585	3590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206302
79	NC_017233	GAC	2	6	3676	3681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206302
80	NC_017233	A	6	6	3703	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
81	NC_017233	TAAA	2	8	3716	3723	75 %	25 %	0 %	0 %	384206302
82	NC_017233	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206302
83	NC_017233	TTA	2	6	3814	3819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206302
84	NC_017233	ATA	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206302
85	NC_017233	ACAA	2	8	3890	3897	75 %	0 %	0 %	25 %	384206302
86	NC_017233	A	8	8	3903	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
87	NC_017233	GAA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206302
88	NC_017233	A	6	6	3930	3935	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
89	NC_017233	AT	3	6	3949	3954	50 %	50 %	0 %	0 %	384206302
90	NC_017233	TAGTAA	2	12	4269	4280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206303
91	NC_017233	ATT	2	6	4298	4303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206303
92	NC_017233	TAT	2	6	4333	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206303
93	NC_017233	AATTGC	2	12	4371	4382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206303
94	NC_017233	ATT	2	6	4577	4582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206304
95	NC_017233	ACTA	2	8	4619	4626	50 %	25 %	0 %	25 %	384206304
96	NC_017233	TAA	2	6	4633	4638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206304
97	NC_017233	ATT	3	9	4695	4703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206304
98	NC_017233	AAT	2	6	4721	4726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206304
99	NC_017233	CTA	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206304
100	NC_017233	TTATT	2	10	4787	4796	20 %	80 %	0 %	0 %	384206304
101	NC_017233	CTT	2	6	4807	4812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206304
102	NC_017233	CTT	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206304
103	NC_017233	TA	3	6	4841	4846	50 %	50 %	0 %	0 %	384206304
104	NC_017233	GCT	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206304
105	NC_017233	AT	3	6	5044	5049	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
106	NC_017233	T	7	7	5072	5078	0 %	100 %	0 %	0 %	384206305
107	NC_017233	AGA	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206305
108	NC_017233	T	6	6	5146	5151	0 %	100 %	0 %	0 %	384206305
109	NC_017233	A	7	7	5152	5158	100 %	0 %	0 %	0 %	384206305
110	NC_017233	TAA	2	6	5159	5164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206305
111	NC_017233	TAT	2	6	5165	5170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206305
112	NC_017233	TATT	2	8	5195	5202	25 %	75 %	0 %	0 %	384206305
113	NC_017233	T	7	7	5221	5227	0 %	100 %	0 %	0 %	384206305
114	NC_017233	TTTA	2	8	5237	5244	25 %	75 %	0 %	0 %	384206305
115	NC_017233	GCAA	2	8	5250	5257	50 %	0 %	25 %	25 %	384206305
116	NC_017233	AT	3	6	5273	5278	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
117	NC_017233	AT	3	6	5299	5304	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
118	NC_017233	TAT	2	6	5402	5407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206305
119	NC_017233	TAA	2	6	5414	5419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206305
120	NC_017233	TTA	2	6	5444	5449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206305
121	NC_017233	TAATTT	2	12	5468	5479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206305
122	NC_017233	TAA	2	6	5490	5495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206305
123	NC_017233	T	6	6	5505	5510	0 %	100 %	0 %	0 %	384206305
124	NC_017233	A	9	9	5511	5519	100 %	0 %	0 %	0 %	384206305
125	NC_017233	TA	4	8	5631	5638	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
126	NC_017233	TTA	2	6	5647	5652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206305
127	NC_017233	T	6	6	5660	5665	0 %	100 %	0 %	0 %	384206305
128	NC_017233	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206305
129	NC_017233	ATA	2	6	5702	5707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206305
130	NC_017233	A	7	7	5707	5713	100 %	0 %	0 %	0 %	384206305
131	NC_017233	AT	3	6	6615	6620	50 %	50 %	0 %	0 %	384206306
132	NC_017233	CTT	2	6	6635	6640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206306
133	NC_017233	TGT	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206306
134	NC_017233	A	6	6	6670	6675	100 %	0 %	0 %	0 %	384206306
135	NC_017233	ATA	2	6	6729	6734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206306
136	NC_017233	A	6	6	6746	6751	100 %	0 %	0 %	0 %	384206306
137	NC_017233	A	6	6	6770	6775	100 %	0 %	0 %	0 %	384206306
138	NC_017233	TAA	2	6	6808	6813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206306
139	NC_017233	GAA	2	6	6815	6820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206306
140	NC_017233	AAG	2	6	6840	6845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206306
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